汇总：生物信息学常用数据库、软件及下载URL

NCBI []

NCBI (National Center for Biotechnology Information）是所指美国国立微生器物应用资讯里心

EMBL []

欧洲分子微生器物学检验室EMBL（The European Molecular Biology Laboratory）

DDBJ []

DDBJ(DNA Data Bank of Japan)，于1984年建立联系，是世界五大DNA 元资料之一，与NCBI的GenBank，EMBL的EBI元资料联合都是由国际DNA元资料

CNGB []

欧美国内元资料（China National GeneBank）设于深圳大鹏原先区，是继世界五大元资料之后的全球性第四大国内级元资料。它是欧美首个，也是唯一一个国内性状库，相对于全球性另外三个性状库而言，国内性状库仪器保存的规模、存储量和可访问的资料量大多是全球性最主要。

BIGD []

欧美国内性状组科学SAN 生命与身心健康大SAN (National Genomics Data Center BIG Data Center)

miRBase []

piRNAbank []

piRNAbank []

SILVA []

LncRNAdb []

真核微生器物

LncRNAwiki [_Page]

生命体长非UTF-RNA元资料

Rfam[]

类似于Pfam的RNA后代评注元资料

Human protein atlas [ ]

人体抗原在线粒体、民间组织、病理条件下的暗示

Pfam []

Pfam是抗原质后代的元资料，仅限于使用隐马尔可夫模型效用于的评注和多数列辨识。

SwissProt []

手动评注的非冗余抗原数列元资料

UniProt [ ]

PIR []

Antibodies []

BRENDA [ ]

HPRD []

InterPro []

通过为基础多个抗原系统性元资料，提供了一个简便的对抗原数列顺利完成系统评注的平台，仅限于对抗原质后代、结构设计域、系统残基的预期

iProClass []

PRF []

REBASE []

PDB []

通过检验检测的结构设计

SCOP []

CATH []

PSI []

PROSITE []

最全面

Pfam []

最专业

ProDom []

CCD []

Prints []

SMART [ ]

TIGRFAM []

STRING []

DIP []

检验验证的抗原相互效用元资料

BioGRID [] ：

IntAct [ ]

MapMan：一个系统强大的线粒体内捷径查看和总编软体

KEGG []

GO []

NCBI BioSystems []

IMP []

plantCyc []

MANET [ ]

MetaNetX [ ]

MataboLights []

HMDB []

YMDB []

ECMDB []

Planteome []

dbGaP []

IPPN []

GeneCard []

Gene Wiki[_Wiki ]

Blast []

Interproscan []，

WEGO []

KAAS []

FGENESH []

AUGUSTUS [ ]

GENESCAN []

GeneMark []

Glimmer []

Exon-Intron Graphic Maker []

根据候选性状的遗传器物质和内含子等资讯所画性状结构设计

Blastp [_TYPE=BlastSearch&LINK_LOC=blasthome]

可在线获取抗原结构设计域的评注和方位资讯

ArrayExpress [ ]

资料来自EMBL的小分子系统性状组学检验的资料；

BAR []

在研究性状系统时，不一定会参考性状的暗示Mode，即性状在植器物各有不同民间组织各有不同退化时期的暗示丰度波动。通过在线研究FacebookBAR对候性状顺利完成暗示研究。 是一个植器物生信研究资源Facebook，用该Facebook研究性状暗示时，不仅可以获得性状暗示Mode的热图，还可以获得可视化的电子荧光截图，直观显现出性状在植器物民间组织里的暗示方位。

GSDS []

Gene Structure Display Server，基于性状组评注文件所画数列性状结构设计等系统

ProtParam []

抗原特性研究是所指抗原的一些电学和化学实例，如熔点、等电点、多肽和原子都是由、消光乘积、半衰期、不保持稳定乘积、糖类族多肽所指数、亲疏松。这些实例，有助于顺利完成抗原的系统性生化检验。比如在体外体系（酵母菌、发酵等）暗示和纯化借以抗原时，需要考虑抗原的熔点、等电点、消光乘积、不保持稳定乘积和亲疏松等。在激酶活检验里，也需要根据这些实例优化检验体系。

Protscale []

抗原多肽的亲旨疏松主要由其侧链基团R，如果R只是H或是C、H两元素都是由的话，都是旨水的，如果成分极性侧链基团，如-OH、-SH、-COOH、-NH2 等，则就是极性的（亲水的）。旨疏松多肽有乙酰、色氨酸、苯丙氨酸、缬氨酸、氨基酸、异氨基酸、丙氨酸和丝氨酸（甲硫氨酸）。旨疏松多肽在抗原质内部，在保持抗原质的三级结构设计上，激酶和基质、抗体和抗原时有的相互效用等各种非碳原子的分子相结合方面，具有关键效用。

TMHMM []

抗原的横跨上皮线粒体结构设计研究对于预期抗原的亚线粒体适配密切系统性。如果具有横跨上皮线粒体结构设计，抗原很不太可能定设于线粒体里与上皮线粒体系统性的结构设计，如线粒体质上皮线粒体、细胞质上皮线粒体或线粒体上皮线粒体等内上皮线粒体系统。此外，抗原横跨上皮线粒体结构设计研究对于抗原系统研究也有一定的设法。比如某抗原没有横跨上皮线粒体结构设计，但是亚线粒体适配检验显示其可定设于上皮线粒体系统性结构设计，这说明该抗原不太可能通过其他上皮线粒体适配抗原招募过去的。

SignalP []

崖瞬时方位为瞬时肽研磨点，崖之前的数列为瞬时肽

瞬时肽是所指所指引原先制备的抗原质向黏液通道重新分配的粗壮肽链，常设于抗原的N-侧边，主要职责把抗原质所指引到各有不同上皮线粒体结构设计的亚线粒体内。UTF-黏液抗原的mRNA在里文时首先制备N侧边的瞬时肽，它被瞬时肽识别系统抗原(SRP)所识别系统，SRP将核糖体携带至线粒体核上，线粒体核上皮线粒体上的 SPR 激酶识别系统并与之相结合。原先制备抗原在瞬时肽所指引下到达线粒体核内腔，而瞬时肽则在瞬时肽激酶的效用下被切除。由于它的所指引，原先生的衍生物就必须通过线粒体核上皮线粒体带入腔内，最终被黏液到胞外。在消化道菌里暗示特罗斯季亚涅齐抗原时，需用瞬时肽所指引特罗斯季亚涅齐抗原适配黏液到胞外，提高抗原氟化器物，在原核暗示系统（酵母菌、变形虫杆菌等）和真核暗示系统（如毕赤发酵）里均有应用。

NetPhos []

KinasePhos-2.0 []

抗原质线粒体所指由抗原质丝氨酸催化的把 ATP 的磷酸基重新分配到底器物抗原质多肽残基（丝氨酸、苏氨酸、乙酰）上的过程，或者在瞬时效用下相结合 GTP（不一定以 GTP 过渡到 GDP），是微生器物体内一种普通的调节方式也，在线粒体瞬时转导的过程里起关键效用。在瞬时达到时通过获得一个或几个磷酸集团而被激活，而在瞬时弱化时能转换成这些集团，从而耗尽活性。有时某个瞬时抗原线粒体不一定致使三角洲的抗原依次发生线粒体，演化成线粒体诱导化学反应。

二、微生器物资讯学软体及下载关键字：

Clustal:

MEGA:

MAFFT:

Sequence Matrix:

PGDSpider:

DnaSP v6:

Arlequin:

MapMan：

PartitionFinder:

jModelTest:

IQ-TREE:

IQ-TREE在线:

RaxmlGUI:

Mrbayes 3.2.7:

PhyloSuite:

BEAST:

Figtree:

Tracer:

PopART:

Network:

Structure:

CLUMMP:

Distruct:

Migrate-N:

Phylonet: 或