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Sci Rep:5-miRNA标签特征可作为食管鳞状细胞癌的预后生物体标志物

2021-12-27 01:44:28 来源:
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这项研究旨在确定一种可以数据分析食管鳞状细胞肿瘤(ESCC)病症基本上生存率(OS)的miRNAs标签。

从NCBI GEO获得119名ESCC病症的miRNA理解谱及其可视的医学接收者,并将其作为专业训练集。在后期和末期样本间筛选差异理解的miRNAs(DEmiRNAs)。采用Cox重回系统性、递归特征扫除(RFE)-默许向量机(SVM)算法和LASSO Cox重回模型来识别生存率功能性miRNAs,从而创设生存率打分模型。此外,数据分析了这些生存率功能性miRNAs的有前途靶基因,然后构建了miRNA靶基因在线。通过功能富集系统性,系统性了ESCC中这些生存率功能性miRNAs数据分析靶基因的功能具体功能性。

在专业训练大部分,后期与末期样本有46个DEmiRNAs。创设了基于5个miRNAs的几率打分模型。该5-miRNA几率打分可以将专业训练集分别为OS时间明显不同的高危组和低危组。在一个来自肿瘤症基因组图谱(TCGA)的单一数据大部分,成功测试了5-miRNA几率打分的几率由上而下能力。尚未有了与这些miRNAs具体的各种生物学步骤和渠道,例如Wnt路径渠道、TRP通道的瘙痒真空调节渠道和睾酮路径渠道。

这项研究预设,与病理已确定具体的5-miRNA标签对数据分析ESCC病症的生存率具有医学意义。

零碎出处:

JunYu. Characterization of a five-microRNA signature as a prognostic biomarker foresophageal squamous cell carcinoma. Sci Rep. 27 December 2019.

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